そういうのは通常は期間BANからで、すぐに永久凍結とかはしないと思うよ。（調査もいるし）
ただ実際にマクロを触っていたとのことなので、そこをどう判断されるかは運営次第。

課金履歴あるいは月額だけでも課金してたら復帰できるんじゃないかって勝手に思ってるけど、どうなんだろうね

抜けがあったらごめんなさいですけど

・速射で稼ぐダメージディーラーを採用した時
・装甲にコアが隠れてたり触手にコアが付いてたりで自動照準がコアを狙ってくれない時
・ヒット判定が複数ある敵や、適正距離の関係上、自動照準が狙う場所以外を撃った方が良い時

…が主に完全手動を使う状況だと思われます。

今回のアニヒリオのような相手では完全手動に拘る意味はあまりないかな、と。
一応アンカー等を操作してる時に、常時コアヒットしながら速射出来るレベルのエイム精度と集中力がある人が速射し続ければ若干スコアは伸びるはずですが…

面談6：指揮官様、あの２匹のカニが見えますか？
▲よちよち歩く姿がかわいいな
・ん …？どこだ …？

アホなことしてしまった…
PCでニケ起動しながら、ニケ用途では全くない、普段使いようのマウスマクロ組んでたらアカ停止くらったぜ
問い合わせ中だけど復旧無理なら潔く引退かねえ

フルバーストタイムも最後確保できなくなるしね。

さすがに処理落ちが起こると、補正が効いてもMG等はかなり下がるしな
旅行中、ホテルのWi-Fiが遅くてシャレならんほどダメージ下がった

大雑把にいうと、基礎攻撃×攻撃バフ×属性バフなのだから、有利OP10%程度の差では攻撃OP等の差で簡単に覆る
基礎攻撃100としてスキルのバフ抜きで超簡略化すると、
100×1.00×2.00＝200（攻撃0、有利90）
100×1.10×1.90＝209（攻撃10、有利80）
100×1.40×1.90＝266（攻撃40、有利80）
となるため有利だけで語ってもあまり意味ない
装備、凸、コンソールで最初の100の部分も変わる
蛇足だけどバフ効果次第でOPが与える影響力も変わる。水着マルチャーナは自己バフ多いから相対的にOPの効果は少なくなる

基本はコアだね。
連射武器は狙いやすいので手動でも当たりやすいけど、
おっしゃるようにゲージ稼ぎのためにチャージ武器を操作キャラにする
ことが多いので手動だと外す人は結構いる。（実際難しい、特にRL）
メイドアンカーみたいに速射でダメージ伸びるキャラはな速射しがちだけど、
それでコアを外してるタイミングが増えてたら本末転倒。

ギミック的にも範囲任せでパーツ破壊が遅れてバリアが出ちゃったとか
カラス狙わなくても何とかなるシーンでコア狙ってないとかもあるかもね。

横からでしかも今更の質問で申し訳ないんだけど、完全手動とセミオートだとどういうところで手動が有利になるんです？
SR操作キャラのバースト生成量が増える、アリスのバーストが速く撃てる、前回のウルトラだと自動照準の上を狙うとコアヒットする等はわかるんですが
コア有りで動くボスだとオートの方がコアヒット率が上がると思うんですが、それとも意外と外してたりパーツを狙ったりでダメージロスしてるってことなんですかね？