右上の時間とターンが書かれているところを押してみてください
止まると思います
もう一度押せばもう一度動き出すと思います

傀儡文明の解放をする時に、現在存在しないがそのシナリオにはその国家は存在していて、その領土を一部でも保有していれば文明を選択せずにその国が選べます、その時に自国の政治体制が共産主義なら傀儡国も同じ政治体制になります

新しいゲームを押した後の左下の細々した設定に、ランダムなプロヴィンスみたいなのがあると思うのでそれがオンになっていませんか？

複数カ国と関係の改善、もしくは批判をしていると常時交渉ポイント(外交ポイント)を使い続けるので、関係の改善や批判している国を減らせば元に戻るかと

終了時期を設定していないからイベントがまだ起きてないだけで設定できているなんてことはないですか？

途中から移動先で遠くの海をまたいだ場所に移動する事ができなくなるます、改善策はありますか？

傀儡国の政府の種類を変えることはできますか？
史実でソ連がルーマニアを占領した後に共産化させて独立させたのを再現したいと思っているのですが...

交渉ポイントが回復しなくなったのですが、原因と対処法を教えていただきたいです

変えられますよ。

同盟名って変えられませんかね