バグ

現在確認されているバグを列挙する。

順位バグ

オンラインレースで発生。特定のプレイヤーが「同じ周回数のプレイヤーの中で一番後ろの順位」になる。
この挙動のため、「唐突に特定のプレイヤーが順位表に現れる」「ゴール後に順位がどんどん下がっていく」などの現象が発生する。
一位のプレイヤーが順位バグに陥ると、おっかけボールにも影響がおよぶ。（おっかけボールを使用したプレイヤー画面での一位を追いかける）

周回バグ

特定のコース（はぐるま トロッコこうざん、むじゅうりょくステーションなど）の特定の位置でコースアウトすると発生。周回の判定が正常に行われなくなる。
発生すると「むきが はんたいだよ」が定期的に出現するようになる。コースアウトしてアクアクに戻されると直る。

スタートダッシュバグ

オンラインレースで発生。スタートダッシュのタイミングがプレイヤーによってずれてしまい、1人だけ先にスタートしたり、1人だけ取り残されて遅れてスタートさせられてしまうバグ。特にスイッチ版で多く見られる。
スイッチ版については、「金のりんご」がコース内に発生しているとき、特に起こりやすいとされる。これはレース前のオープニングムービーをスキップしたとき、ゲームが金のりんごを読み込む時間がスタートダッシュのタイミングに間に合っていないプレイヤーがいるためだという説がある。対策として、オープニングムービーをスキップせずに最後まで見ることで読み込み時間に余裕を持たせると防げることが多い。

位置情報のズレ

オンラインレースで発生。バグというよりは、常時発生している欠陥点に近い。ホストとの位置情報のズレにより、本来より遅い位置にレーサーが表示されたり、本来なら当たってない判定のアイテムが当たったりすることが頻繁にある。特にプレイヤー情報のズレにかんしては、全ての位置情報はホストを中心に決められているためそれ以外のプレイヤーは常に本来よりも（0.5秒ほど？）後ろに表示されている。そのためレース画面では先にゴールしたのに結果のタイムを見ると負けていることがある。
またアイテムに関しても、オイルを避けたのに0.5秒ほどあとに当たり判定を下されたり、ドクロ爆弾が転がる軌道上にいなかったのに当たったことになっていることがある（ただし後者に関しては、りんご10個で使用されたドクロ爆弾の爆風範囲が広いだけだということもある）。
詳しくはオンラインレースを参照。

あめふりオイルの雨雲の残留

あめふりオイルを受けたあと、効果時間を終了しスピードも通常時に戻ったのに、雨雲のエフェクトだけ残りつづけることがある。

TNT箱の消滅

かぶったはずのTNTが、5回ジャンプしていないのに突然消滅することがある。このとき透明なTNT箱をずっとかぶった状態になっているためか、アイテムを一切使用することができない。被弾をしたりコースアウトすると治ることがある。
またTNT箱が消滅したとき、使用キャラクターの頭部のグラフィックが一緒に消滅することが稀にある。

おっかけボールバグ

アイテム「おっかけボール」を使用したはずなのに、おっかけボールが一位を攻撃せず素通りしてそのままコースをもう一周するバグがある（一位が分岐などで追っかけボールの軌道を撒いて避けたような場合はバグに含めない。）

シールドバグ

みどりシールド・あおシールドを前方に発射したのに、とくに発射されることもなくその場で破裂して消滅することがある。この現象は空中でみどりシールド・あおシールドを貼った場合にのみ発生するため、地上で貼るようにすると問題なく発射することができる。