コリオバクテリウム綱

コリオバクテリウム綱
分類
ドメ イン : 真性細菌Bacteria 門 : 放線菌門Actinobacteria 綱 : コリオバクテリウム綱Coriobacteriia König 2013 emend. Gupta et al. 2013
シノニム
Coriobacteridae Stackebrandt et al. 1997 emend. Zhi et al. 2009
目／科
Coriobacteriales Stackebrandt et al. 1997 emend. Gupta et al. 2013 * Atopobiaceae Gupta et al. 2013 * Coriobacteriaceae Stackebrandt et al. 1997 emend. Gupta et al. 2013 Eggerthellales Gupta et al. 2013 * Eggerthellaceae Gupta et al. 2013

コリオバクテリウム綱（コリオバクテリウムこう、Coriobacteriia）とは放線菌門における綱の一つである。この綱の生物種の特徴には胞子の非生産性、偏性/通性嫌気性がある。Gordonibacter属は唯一この綱で鞭毛を持ち運動性を有する。この属以外は運動性を持たない。幾つかの種は危険な病原性を有する。Atopobium属、Olsenella属およびCryptobacterium属は口内感染性を持ち、歯周病、口臭、その他の歯内療法学的疾病の原因となる。Eggerthella属は菌血症と潰瘍性大腸炎を引き起こす。

特徴[編集]

当初、コリオバクテリア綱は単一の目（コリオバクテリウム目）と単一の科(コリオバクテリア科)のみを有していた。しかし、現在では綱内の属種には分類学上異なる地位であることを示すconserved signature indels (CSIs)を有しており、その進化的関係は単一の分類項目にまとめることは不適切であることが分かっている 。このCSIsは特異的であり、この遺伝的特徴によりコリオバクテリウム綱は区分される。また、CSIsによる区別は目や科のレベルにおいて共有派生形質の違いを反映する。例えば、コリオバクテリウム目（Coriobacteriales）は糖分解性でありグルコース発酵をできるが、Eggerthellales目には非糖分解性でありグルコースを発酵できない種がいる。

CSIsは放線菌門の他の分類項目からコリオバクテリウム綱を区別する根拠に用いられてきた。CSIsの分析によると、コリオバクテリウム綱は放線菌門の中でも古い分類系統である。この綱が本当に放線菌門所属で適切であるかどうかの議論もある。例えば、コリネバクテリウム鋼の微生物は全て、デオキシウリジン59-三リン酸（dUTP）ヌクレオチド加水分解酵素におけるある一つのアミノ酸挿入の形態に関するCSIを共有する。他にこのCSIを持つのは放線菌門の一部の種のみである。このCSIは、放線菌門におけるコリネバクテリウム綱の関係を明確に示す指標の一つである。

分類系統[編集]

2016年現在のコリネバクテリウム綱の分類体系は以下の通りである（米国立生物工学情報センター）。2つの目、3つの科、16の属を有する。

• コリネバクテリウム目 Stackebrandt et al. 1997 emend. Gupta et al. 2013
  • Atopobiaceae科 Gupta et al. 2013
    • Atopobium属 Collins & Wallbanks 1993
      • Atopobium deltae Cools et al. 2014
      • Atopobium fossor (Bailey & Love 1986) Kageyama, Benno & Nakase 1999
      • Atopobium minutum (Hauduroy et al. 1937) Collins & Wallbanks 1993
      • Atopobium parvulum (Weinberg, Nativelle & Prevot 1937) Collins & Wallbanks 1993
      • Atopobium rimae (Olsen et al. 1991) Collins & Wallbanks 1993
      • Atopobium vaginae Rodriguez Jovita et al. 1999
    • Olsenella属 Dewhirst et al. 2001 emend. Kraatz et al. 2011
      • Olsenella profusa Dewhirst et al. 2001 emend. Kraatz, Wallace & Svensson 2011
      • Olsenella scatoligenes Li et al. 2015
      • Olsenella uli (Olsen et al. 1991) Dewhirst et al. 2001 emend. Kraatz, Wallace & Svensson 2011
      • Olsenella umbonata Kraatz, Wallace & Svensson 2011
  • コリネバクテリア科 Stackebrandt et al. 1997 emend. Gupta et al. 2013
    • Collinsella属 Kageyama et al. 1999 emend. Kageyama & Benno 2000
      • Collinsella aerofaciens (Eggerth 1935) Kageyama, Benno & Nakase 1999
      • Collinsella intestinalis Kageyama & Benno 2000
      • Collinsella stercoris Kageyama & Benno 2000
      • Collinsella tanakaei Nagai, Watanabe & Morotomi 2010
    • Coriobacterium属 Haas & Konig 1988
      • Coriobacterium glomerans Haas & Konig 1988
    • Enorma属 Mishra et al. 2013
      • Enorma massiliensis Mishra et al. 2013
    • Parvibacter属 Clavel et al. 2013
      • Parvibacter caecicola Clavel et al. 2013
    • Senegalimassilia属 corrig. Lagier et al. 2014
      • Senegalimassilia anaerobia corrig. Lagier et al. 2014
• Eggerthellales目 Gupta et al. 2013
  • Eggerthellaceae科 Gupta et al. 2013
    • Adlercreutzia属 Maruo et al. 2008
      • Adlercreutzia equilofaciens Maruo et al. 2008
    • Asaccharobacter属 Minamida et al. 2008
      • Asaccharobacter celatus Minamida et al. 2008
    • Cryptobacterium属 Nakazawa et al. 1999
      • Cryptobacterium curtum Nakazawa et al. 1999
    • Denitrobacterium属 Anderson et al. 2000
      • Denitrobacterium detoxificans Anderson et al. 2000
    • Eggerthella属 Wade et al. 1999 emend. Würdemann et al. 2009
      • Eggerthella lenta (Eggerth 1935) Wade et al. 1999 emend. Maruo et al. 2008
      • Eggerthella sinensis Lau et al. 2006 emend. Maruo et al. 2008
    • Enterorhabdus属 Clavel et al. 2009 emend. Clavel et al. 2010
      • Enterorhabdus caecimuris Clavel et al. 2010
      • Enterorhabdus mucosicola Clavel et al. 2009
    • Gordonibacter属 Wurdemann et al. 2009
      • Gordonibacter faecihominis Jin et al. 2015
      • Gordonibacter pamelaeae Wurdemann et al. 2009
      • Gordonibacter urolithinfaciens Selma et al. 2014
    • Paraeggerthella属 Wurdemann et al. 2009
      • Paraeggerthella hongkongensis (Lau et al. 2006) Wurdemann et al. 2009
    • Slackia属 Wade et al. 1999 emend. Nagai, Watanabe & Morotomi 2010
      • Slackia equilofaciens Jin et al. 2010
      • Slackia exigua (Poco et al. 1996) Wade et al. 1999
      • Slackia faecicanis Lawson et al. 2005
      • Slackia heliotrinireducens (Lanigan 1983) Wade et al. 1999
      • Slackia isoflavoniconvertens Matthies, Blaut & Braune 2009

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